“时效性差，无法明确病原，如何合理选择抗菌药物”，是当前临床感染性疾病诊治面临的突出问题。

为了能更好地解决临床的困惑，西安区域医学检验中心临床微生物部充分利用数字PCR和mNGS等多种技术方法快速精准诊断感染性疾病。本期推出第一篇文章，感染性疾病的快速精准诊断之《mNGS这张大网如何为临床捞出更多“漏网之鱼”？》

虽然mNGS并不是一项传统的微生物学项目，但其依然遵循行业标准《WS/T-640临床微生物学检验标本的采集和转运》的要求，合格的标本质量是保证检测结果的前提，特别是对于送检最多的呼吸道标本，标本质量的评价与检出结果的联合报告才能真正解释临床的困惑。例如，肺泡灌洗液（BALF）是临床送检mNGS最多的标本类型，但BALF如何评判采集质量？做出阴性结果是真阴性还是标本质量不佳？临床长时间送检阴性率过高是什么原因？

西安医检微生物部

基于细胞分类的BALF标本质量评估是上述几个问题的答案，镜检上皮细胞和有核细胞的含量和比例与致病微生物检出密切相关，BALF标本质量的反馈可以帮助临床优化采集方法，减少临床对于阴性检出的困惑，提高mNGS检出率。

02.传统手段结合mNGS帮助临床解读报告

mNGS经常会检出条件致病菌，但这些条件致病菌到底与患者感染是否相关，无论是基于序列数、相对丰度等，无法去真正判断。因为数据量和背景菌的差异会因实验室而异。这时候我们不能忘记传统的涂片镜检和培养，镜检微生物种类和数量，与白细胞相关性以及定量/半定量培养结果等非常有助于区分检出微生物是否为真正的感染病原体。已有的行业标准和规范依旧适用于mNGS，传统方法与新技术相结合可以更好地为临床提供帮助。

Illumina平台

华大平台

mNGS做为一项新技术目前已经较为广泛地应用于临床感染性疾病的诊断，西安医检基于华大和Illumina双测序平台常规开展mNGS检测服务，24小时内由专业的临床微生物检验医师出具检测报告。西安医检不仅在测序实验质控和生信分析上严格控制质量，更从临床微生物学的角度出发，主打“mNGS+传统微生物学”检测方法，结合涂片镜检评价反馈标本质量，测序结果结合涂片镜检分析甚至培养药敏结果更精准地解读mNGS检测结果和报告。

03.专家会诊助力临床诊治

这天，西安医检临床微生物部收到一份紧急样本。

一位28岁患者因头痛发热等中枢神经系统症状入院，临床结合脑脊液常规和其他检查判断患者可能为病毒所引起的中枢神经系统感染，但采用抗病毒治疗无效且脑脊液培养阴性，于是送检到我中心做脑脊液mNGS检测，结果检出布鲁氏菌属序列66条，徐修礼教授和多位具有丰富临床微生物经验的老师组成的会诊团队通过详细询问病史，患者长期从事动物交易活动，并给患者加做的布鲁氏菌IgG抗体也为阳性，建议临床由抗病毒治疗转为针对布鲁氏菌治疗，最终患者通过针对性治疗取得了积极的疗效。

西安医检微生物专家团队正在参与会诊

mNGS做为一种新技术新方法具有其不可替代的优势，但正确的应用才能更好地为临床提供决策依据。西安医检“mNGS+传统微生物学”的组合拳就是要提高mNGS标本送检质量，结合临床微生物严格把控实验全流程质量，为临床出具更为准确的报告，并在需要时通过专家会诊为临床感染性疾病提供专业的指导意见，真正让mNGS成为临床感染性疾病诊疗的利器。

如果您有相关检测需求

请在工作时间内与戴女士联系：18149063767

西安医检主打“mNGS+传统微生物学”组合拳